県南果樹部は五戸町に所在しており、主にリンゴ以外の果樹（青森県では特産果樹と呼称）を扱っています。
ブドウ、オウトウ、モモ、セイヨウナシなどの栽培・育種・病害虫に関する研究のほか、生育等の情報提供を行っています。

1. 青森ブランド特産果樹の安定生産技術に関する研究
2. 特色ある特産果樹の新品種の育成・選定
3. 青森ブランド特産果樹の病害虫防除に関する研究
4. オウトウ「ジュノハート」のブランド化促進に係る調査研究
5. 特産果樹の病害虫に対する新農薬の実用性に関する研究
6. 果樹カメムシ類の発生予察に係る調査研究
7. 特産果樹の生育と気象に関する調査研究 

• 部長：１名
• 研究部門
  　研究員･･･栽培・育種分野：３名、病害虫分野：３名
  　非常勤労務員：２名
  　技能技師：３名
  　非常勤技能員：１名
• 庶務事務部門
  　主事：１名
  　非常勤事務員：１名

• 特産果樹の生育ステージ、果実肥大、熟度調査